Epífitas Herbario JAUM

Álvaro Idárraga1, Daihana Arango2, Ana María Benavides2, Daihana Arango1, Ana María Benavides3

1 Fundación Jardín Botánico de Medellín Joaquín Antonio Uribe, Medellín, Colombia; 2 Fundación Jardín Botánico de Medellín Joaquín Antonio Uribe, Medellín, Colombia; 3 Fundación Jardín Botánico de Medellín Joaquín Antonio Uribe, 

Corresponding author(s): Álvaro Idárraga (alvaro.idarraga@jbotanico.org)Daihana Arango (daihana.arango@jbotanico.org)Ana María Benavides (anamaria.benavides@jbotanico.org), Daihana Arango (daihana.arango@jbotanico.org), Ana María Benavides (anamaria.benavides@jbotanico.org)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Idárraga Á, Arango D, Benavides A M (2022): Epífitas Herbario JAUM. v1.7. Test Organization #1. Dataset/Occurrence. https://ipt.gbif.org/resource?r=jaum-bid-ca2020&amp;v=1.7

Abstract

En el marco del proyecto BID-CA2020-047-USE llamado "Colecciones basadas en datos para acciones de conservación: involucrando a los tomadores de decisiones para salvar epífitas amenazadas en Colombia", financiado por el programa de información sobre Biodiversidad para el Desarrollo (BID), presentamos nuestro primer conjunto de datos sobre especies epífitas del herbario Joaquín Antonio Uribe de Medellín (JAUM). Este conjunto de datos contiene un total de 6.585 registros de plantas y líquenes, correspondientes a las familias: Araceae (1.513 registros, 255 especies), Aspleniaceae (185 registros, 29 especies), Bromeliaceae (36 registros, 12 especies), Cyclanthaceae (265 registros, 29 especies), Dryopteridaceae (140 registros, 53 especies), Gesneriaceae (346 registros, 71 especies), Hymenophyllaceae (88 registros, 28 especies), Lobariaceae (un registro, una especie), Lomariopsidaceae (22 registros, 5 especies), Oleandraceae (5 registros, 2 especies), Orchidaceae (2.975 registros, 972 especies), Peltigeraceae (un registro, una especie), Piperaceae (453 registros, 90 especies) y Polypodiaceae (555 registros, 100 especies).  El conjunto de datos corresponde a un 96% de registros con habito Epífito, el restante 4% a registros con habito Hemiepífito y Trepador.  

Hasta el momento 4.794 registros cuentan con coordenadas y, un restante de 1.791 está en proceso de georreferenciación.

Keywords: Occurrence, Specimen

Project details

Project title: Colecciones basadas en datos para acciones de conservación: involucrando a los actores en la toma de decisiones para salvar epífitas globalmente amenazadas en Colombia
Personnel: Daihana Arango, Alexandra Guerra, Angie Martínez
Funding: GBIF, Unión Europea
Study area descriptions/descriptor: Colombia
Design description: Iniciamos con la migración de la información que se encuentra sistematizada por el Herbario JAUM al estándar Darwin Core, con la posterior adición de registros que fueron sistematizados en el proceso. Con estos registros comenzamos el proceso de depuración, estandarización de los datos y la elección de las familias a priorizar para el proyecto, las cuales comprendieron: Araceae, Bromeliaceae, Cyclanthaceae, Dryopteridaceae, Gesneriaceae, Hymenophyllaceae, Lobariaceae, Lomariopsidaceae, Olenadraceae, Orchidaceae, Peltigeraceae, Piperaceae, y Polypodiaceae. Posteriormente, continuamos con la corroboración y reconstrucción de coordenadas siguiendo los lineamientos Georreferenciación de localidades: Una guía de referencia para colecciones biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, y finalmente la validación de la calidad de los datos en general mediante el data validator GBIF y Open refine, la validación geográfica se realizó en QGIS y Open Refine siguiendo las rutinas de validación del Laboratorio de validación y limpieza del  SiB Colombia.

Data published through GBIF: https://ipt.gbif.org/resource?r=jaum-bid-ca2020

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Todos los registros de plantas vasculares fueron identificados hasta familia, género y especie. En cuanto a los líquenes, se identificaron hasta género.
Taxonomic ranks
Family: Araceae, Bromeliaceae, Cyclanthaceae, Gesneriaceae, Dryopteridaceae, Hymenophyllaceae, Orchidaceae, Piperaceae, Olenadraceae, Lomariopsidaceae, Polypodiaceae, Peltigeraceae, Lobariaceae

Spatial coverage

General spatial coverage: Los registros corresponden únicamente a colecciones de Colombia. En detalle, el mayor número de registros se encuentran en Antioquia con un 57 %, seguido de los departamentos de Chocó (11%) y Santander (6%). El menor porcentaje se presentó en los departamentos de Casanare y Magdalena. En general, el 75% de los registros hacen parte de la región Andina, 18 % al Pacifico, 2.6 % a la Amazonia, 1.8 % al Caribe y 0.5 % a la Orinoquia.
Coordinates: 4°12'54''S and 13°45'10.8''N Latitude; 81°33'43.2''W and 64°9'36''W Longitude 

Temporal coverage: 1940 - 2022

Temporal coverage: December 2, 2021 - May 12, 2022

Natural collections description

Collection name: Herbario JAUM
Specimen preservation method: Dried and pressed

Methods

Method step description: Se utilizaron herramientas como R, QGIS, Excel y Open Refine
Study extent description: Colombia
Sampling description: Colecciones botánicas

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Epífitas Herbario JAUM
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://ipt.gbif.org/archive.do?r=jaum-bid-ca2020
Publication date of data: 2022-06-15
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2022-04-25
Hierarchy level: Dataset