Banco de semillas del caribe colombiano

Diego Fernando Escobar1, Santiago Madriñan1, Viviana Londoño-Lemos1, Maria Paula Contreras2, Fundación Jardín Botánico "Guillermo Piñeres" Fundación Jardín Botánico "Guillermo Piñeres"3, Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia - SiB4

1 Fundación jardín botánico de Cartagena “Guillermo Piñeres", Jardín Botánico de Cartagena “Guillermo Piñeres” Sector Matute, km 9 Autopista I-90, 131007, Turbaco, Colombia; 2 Fundación jardín botánico de Cartagena “Guillermo Piñeres&quot;, Jardín Botánico de Cartagena “Guillermo Piñeres” Sector Matute, km 9 Autopista I-90, 131007, Turbaco, Colombia; 3 Fundación Jardín Botánico "Guillermo Piñeres", Jardín Botánico de Cartagena “Guillermo Piñeres” Sector Matute, km 9 Autopista I-90, 131007, Turbaco, Colombia; 4 Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia, Calle 28 A No. 15 -09, Bogotá, Colombia

Corresponding author(s): Diego Fernando Escobar (ciencia@jbgp.org.co)Santiago Madriñan (santiago.madrinan@jbgp.org.co)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Escobar D F, Madriñan S (2022): Banco de semillas del caribe colombiano. v1.0. Test Organization #1. Dataset/Occurrence. https://ipt.gbif.org/resource?r=banco_semillas_jbgp&v=1.0

Abstract

El banco de semillas del Jardín botánico de Cartagena tiene como objetivo conservar una muestra representativa de las poblaciones de especies nativas del bosque seco tropical del Caribe colombiano. Los lineamientos de investigación de la colección están orientados a recopilar la mayor cantidad de información biológica y de uso de los especímenes, siguiendo protocolos estandarizados para la recolección, beneficio y almacenamiento de semillas.
Se registran 1673 accesiones colectadas desde 2016. Del total de accesiones, 569 corresponden a semillas vivas almencenadas en el banco de semillas. La actualización y publicación de las accesiones fue implementada por la Fundación jardín botánico de Cartagena bajó el proyecto "Opening the collections to the world: data mobilization of the Cartagena Botanical Garden collections" financiado por BID-GBIF.

Keywords: Occurrence, Specimen, seed collection, Medium term, natural, Forest, woodland, Wild habitat, Institute, experimental station, research organization, genebank

General description

Purpose: Está base de datos tiene como proposito proveer información ecologica basica que ayude a conservar y proteger el germoplasma y recursos genético de las especies nativas del Caribe colombiano. Además, este recurso permite informar la diponibilidad de semillas en la colección y facilitar su distribuición para investigaciones en propagación de especies nativas colombianas. Finalmente, la divulgación de la base de datos subsidia la creación de redes regionales de conocimiento sobre la conservación y germinación de semillas de especies nativas del Caribe colombiano.

Project details

Project title: Opening the collections to the world: data mobilization of the Cartagena Botanical Garden collections
Personnel: Santiago Madriñan, Diego Fernando Escobar
Funding: Financiado por European Union y GBIF, Programa BID: Biodiversity Information for Development
Identificador del proyecto BID-CA2020-048-INS
Study area descriptions/descriptor: Las colecciones contienen especimenes del Caribe colombiano, especificamente de los departamentos de Bolívar, Atlántico, Magdalena, La Guajira, Cesar, Córdoba y Sucre.
Design description: Las principales actividades del proyecto nos permitirán organizar, digitalizar y publicar los datos biológicos del Jardín Botánico de Cartagena. El Caribe colombiano ha sido históricamente una región con falta de información biótica, y este proyecto aumentará los datos disponibles. Con la curaduría de JBGP Herbarium, tendremos una base de datos de colecciones actualizada que nos permitirá continuar capturando y organizando imágenes de especímenes en alta resolución. Una vez que hayamos digitalizado la información con las imágenes, publicaremos la información del herbario para uso público. Esto es importante ya que el herbario JBGP alberga datos críticos para los estudios de biodiversidad de la región y contribuye a la investigación taxonómica, biogeográfica, sistemática y de biodiversidad. El banco de semillas y la publicación de información sobre la colección viva ayudarán a estudiar la genética y la ecología de los ecosistemas del Caribe.
Los talleres con los investigadores que realizaron los inventarios de flora y fauna ayudarán a publicar esta información y formar investigadores en la publicación y análisis de datos. Estos datos contribuirán a los metanálisis de la biodiversidad. También incluiremos a estudiantes de pregrado y posgrado de universidades locales para explicar los procesos de publicación de datos de GBIF y su importancia. Esto aumentará directamente los datos publicados y alentará a los jóvenes investigadores locales a contribuir a este objetivo. Con más información disponible al público sobre los ecosistemas del Caribe colombiano, contribuiremos a su protección y restauración.
Finalmente, analizaremos la información que recopilamos y organizamos para crear mapas de distribución actualizados de las especies nativas de TDF del Caribe. También utilizaremos el banco de semillas y el herbario para analizar la fenología de las especies nativas del TDF del Caribe a través de los metanálisis de los datos recopilados. El mapa y la información fenológica contribuirán significativamente al desarrollo de planes de investigación y restauración. Publicaremos esta información como artículos científicos y los análisis estarán disponibles para el público.

Data published through GBIF: https://ipt.gbif.org/resource?r=banco_semillas_jbgp

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: 1672 accesiones de plantas con semillas y una accesión que conteniene esporas de helecho (Adiantum raddianum). Las familias más representativas de la colección son Fabaceae, Malvaceae, Bignoniaceae yMeliaceae
Taxonomic ranks
Family: Erythroxylaceae, Erythroxylaceae, Arecaceae, Meliaceae, Fabaceae, Zygophyllaceae, Combretaceae, Bignoniaceae, Capparaceae, Malvaceae, Nymphaeaceae, Salicaceae, Campanulaceae, Paulowniaceae, Asparagaceae, Sapindaceae, Iridaceae, Aristolochiaceae, Rhamnaceae, Pittosporaceae, Gyrostemonaceae, Hernandiaceae, Montiaceae, Solanaceae, Myrtaceae, Lecythidaceae, Asteraceae, Primulaceae, Acanthaceae, Celastraceae, Bixaceae, Oxalidaceae, Cannaceae, Anacardiaceae, Costaceae, Cochlospermaceae, Burseraceae, Lamiaceae, Euphorbiaceae, Apocynaceae, Bromeliaceae, Convolvulaceae, Muntingiaceae, Polygonaceae, Passifloraceae, Malpighiaceae, Araliaceae, Sapotaceae, Cactaceae, Scrophulariaceae, Annonaceae, Rubiaceae, Cordiaceae, Rutaceae, Urticaceae, Turneraceae, Cucurbitaceae, Clusiaceae, Cupressaceae, Calycanthaceae, Picramniaceae, Apiaceae, Dioscoreaceae, Moraceae, Schisandraceae, Moringaceae, Calophyllaceae

Spatial coverage

General spatial coverage: El banco de semillas contiene especiemenes colectados principalmente en la región Caribe de Colombia, incluyendo los departamentos de Bolívar, Atlántico, Magdalena, La Guajira, Cesar, Córdoba, y Sucre. La colección tambien cuenta con especimes donados por jardines botánicos de diferentes países como Inglaterra, Estados Unidos, Australia, Brasil.
Coordinates: 8°34'12''N and 12°37'8.4''N Latitude; 76°39'46.8''W and 71°7'30''W Longitude 

Natural collections description

Parent collection identifier: "Not applicable"
Collection name: Banco de semillas Jardín botánico de Cartagena
Formation period: 2015-current
Specimen preservation method: Dried
Curatorial unit: 81 with an uncertainty of 1 (jars)

Methods

Method step description: 
- . 	1. Se cambiaron las cajas de almacenamiento de la semillas por frascos herméticos.
- . 	2. Se estandarizó el tipo de bolsa de papel de cada accesión y la información contenida en ella. Se revisó el estado fitosanitario de las semillas descartando aquellas con hongos o dagnificadas por insectos.
- . 	3. Se estimó el numero de semillas de cada accesión usando el peso total de las semillas y su peso promedio. Para semillas muy livianas se estimó su cantidad según la superficie ocupada.
- . 	4. Se determinó la tolerancia a la desecación y la forma de almacenamiento según la base de datos de Royal Botanic Gardens Kew (2021)
- . 	5. Se estructuró una planilla de ocurrencias siguiendo el formato Darwin, en la cúal cada accesión fue registrada como una ocurrencia.
Study extent description: Accesiones de semillas depositadas en el banco de semillas del jardín botánico de Cartagena. La colección contiene especiemenes colectados principalmente en la región Caribe de Colombia, incluyendo los departamentos de Bolívar, Atlántico, Magdalena, La Guajira, Cesar, Córdoba, y Sucre. La colección tambien cuenta con especimes donados por jardines botánicos de diferentes países como Inglaterra, Estados Unidos, Australia, Brasil. 
Las accesiones de semillas han sido depositadas desde 2015 hasta la fecha.
Sampling description: El muestreo de los individuos de los cúales se han colectados semillas varia según el colector. Los datos minimos requeridos para depositar semillas en la del jardín botánico de Cartagena (JBGP) son: localidad, fecha de colecta, estado de madurez de los frutos, nombre del colector, número de colecta (solo si la accesión tiene voucher de herbario) e identificación del especimen al menor nivel taxonomico que el colector consiga.
Una vez realizada la recolección y beneficiamiento de las semillas se registra el material vegetal (semillas o frutos secos) en el libro de accesiones del JBGP. Posteriormente, las semillas son almacenas según su tolerancia a la desecación en: frascos herméticos de plástico con sílica gel (semillas tolerantes a la desecación) o en frascos hermeticos sin silica gel (especies intolerantes a la desecación).
Quality control description: Fue revisada la ortografía de las especies y actualizado el estado nomenclatural de los nombres científicos de las accesiones depostidas en el banco de semillas. Se utilizó la herramienta LOOK UP (GBIF Secretariat 2021) para la revisón ortografica y actualización nomenclatural. Los municipios y departamentos colombianos fueron estandarizados siguiendo la base de datos del DANE, y los codigos de los paises siguendo la regla ISO 3166 alpha 2.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Banco de semillas del caribe colombiano
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://ipt.gbif.org/archive.do?r=banco_semillas_jbgp
Publication date of data: 2022-01-27
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2022-01-24
Hierarchy level: Dataset

References
Royal Botanic Gardens Kew. (2021) Seed Information Database (SID). Version 7.1. Available from: http://data.kew.org/sid/ (December 2021)
GBIF Secretariat (2021). GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2021-12-21.