Project metadata - Test DNA derived

Registro biológico
Última versión publicado por Test Organization #1 el abr 23, 2026 Test Organization #1
Fecha de publicación:
23 de abril de 2026
Publicado por:
Test Organization #1
Licencia:
CC0 1.0

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 93.908 registros en Inglés (13 MB) - Frecuencia de actualización: diario
Metadatos como un archivo EML descargar en Inglés (8 KB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Inglés (7 KB)

Descripción

tax_class_id_cutoff: 85Minimum percent identity for taxonomic assignmenttax_class_query_cutoff: 96Minimum percent query coverage for taxonomic assignmenttax_class_collapse: Taxonomic levels were dropped to the lowest common ancestor (LCA) with the similarity thresholds of 99%, and also based on % identify thresholds (>98% species). This was conducted using the LCA_taxonomy script in eDNAFlow https://github.com/mahsa-mousavi/eDNAFlow.How was the taxa collapsed to higher taxonomic levels? i.e. lowest common ancestorscreen_contam_method: Taxa detected in negative controls were checked and removed across curated ASV dataset (i.e. samples)How were contaminations screened and applied in data curation/analyses/interpretation?screen_geograph_method: Distribution information was checked using FishBase and SealifeBase. New eDNA occurrence records in the region were heavily scrutinised; if congeners were not sequenced for targeted gene marker then the taxonomic assignment was collapsed to lowest common ancestor.How were species distribution information screened and applied?screen_nontarget_method: Non-targeted species (i.e. domestic animals, humans and non-marine species) were removed from curated ASV dataset.How were non-target species screened and applied?bioinfo_method_additional: The min_reads_cutoff was 1 read, but singletons were kept if the same sequence was detected in multiple samples.Additional information on bioinformatics, that has not been shared in the given record. [This dataset was processed using the GBIF Metabarcoding Data Toolkit.]

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 93.908 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
93908
dnaDerivedData 
93908

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Test Organization #1. En la medida de lo posible según la ley, el publicador ha renunciado a todos los derechos sobre estos datos y los ha dedicado al Dominio público (CC0 1.0). Los usuarios pueden copiar, modificar, distribuir y utilizar la obra, incluso con fines comerciales, sin restricciones.

Registro GBIF

Este recurso no ha sido registrado en GBIF

Palabras clave

Occurrence

Contactos

Thomas Stjernegaard Jeppesen
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Grenågade 5 4. th
2100 KØBENHAVN Ø
Denmark
DK
  • 61333847

Cobertura geográfica

dtyjdtytj

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180]

Datos del proyecto

Project Description

Título Project Title
Identificador Project Identifier
Fuentes de Financiación Project Funding
Descripción del área de estudio Project Study Area Description
Descripción del diseño Project Design Description

Personas asociadas al proyecto:

Thomas Stjernegaard
  • Editor

Metadatos adicionales