Plankton community in Bongo net (300µm), Tara Oceans cruise

Sampling event
Последняя версия опубликовано 27 августа 2024 г.
Дата публикации:
27 августа 2024 г.
Опубликовано:
No organisation
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 202 Записи в English (374 KB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (52 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (9 KB)

Описание

Tara expeditions sampled the world's oceans with standardized protocols, putting an exceptional effort into sampling plankton diversity across a large size range, using a combination of water samples and net tows. The efforts to explore the genomic diversity of plankton, through metabarcoding and metagenomics, have led to well publicized papers and have made the renown of Tara. While a similar extensive effort has been put on imaging, the datasets are not public yet. In a limited number of stations, in addition to the usual 5µm -> ~5cm Tara sampling strategy, Bongo net samples were taken during the day and during the night, at the same station; this is the content of this dataset. Using a 300µm mesh net, it cover organisms from 300µm to ~3cm more Bongo net (300µm mesh) hauled vertically from 500m depth to the surface, once during the day, and once during the night. Sample preserved in 4% buffered formalin and stored over the long term at the Centre de Collections Planctoniques de Villefranche (CCPv). Sample scanned on a ZooScan, images processed with ZooProcess and sorted taxonomically on EcoTaxa, within the Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv). The PIQv and CCPv platforms are part of EMBRC-France, a national Research Infrastructure supported by ANR, under the reference ANR-10-INSB-02.

Записи данных

Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 202 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Event (core)
202
ExtendedMeasurementOrFact 
26818
Occurrence 
9656

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс не был зарегистрирован в GBIF

Ключевые слова

Plankton; Imaging; EcoTaxa; Samplingevent

Контакты

Amanda Elineau
  • Originator
Céline Dimier
  • Originator
Fabien Lombard
  • Originator
  • Point Of Contact
Gaby Gorsky
  • Originator
Jean-Baptiste Romagnan
  • Originator
Jean-Olivier Irisson
  • Metadata Provider
  • Originator
Laetitia Jalabert
  • Originator
Lars Stemmann
  • Originator
Marc Picheral
  • Originator
Natalia Llopis Monferrer
Sarah Searson
  • Originator
Stéphane Pesant
  • Originator
Stefanie Kandels-Lewis
  • Originator
EMBL
DE
European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Heidelberg
Institut de la Mer de Villefranche (IMEV)
MARUM, Center for Marine Environmental Sciences, University of Bremen
Sorbonne Université/CNRS, Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV)
Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV)
Sorbonne Université/CNRS, Station Biologique de Roscoff
Tara Oceans Consortium

Географический охват

See coordinates

Ограничивающие координаты Юг Запад [-64,355, -168,348], Север Восток [79,218, 174,86]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Subkingdom Harosa
Phylum Annelida, Bryozoa, Chaetognatha, Cnidaria, Ctenophora, Cyanobacteria, Echinodermata, Foraminifera, Mollusca, Nemertea
Subphylum Crustacea
Class Acantharia, Actinopterygii, Appendicularia, Bivalvia, Cephalopoda, Echinoidea, Hydrozoa, Insecta, Ophiuroidea, Ostracoda, Scyphozoa, Thaliacea
Subclass Copepoda, Eumalacostraca, Phaeodaria
Superorder Cladocera
Order Actiniaria, Amphipoda, Calanoida, Cumacea, Doliolida, Euphausiacea, Harpacticoida, Isopoda, Monstrilloida, Mysida, Pteropoda, Pyrosomatida, Salpida, Siphonophorae, Spumellaria
Suborder Gymnosomata, Hyperiidea, Physonectae
Infraorder Achelata, Brachyura
Family Abylidae, Acartiidae, Calanidae, Candaciidae, Cavoliniidae, Centropagidae, Cliidae, Corycaeidae, Creseidae, Diphyidae, Eucalanidae, Euchaetidae, Fritillariidae, Galatheidae, Gammaridae, Heterorhabdidae, Hippopodiidae, Laomediidae, Limacinidae, Metridinidae, Oikopleuridae, Oithonidae, Oncaeidae, Oxycephalidae, Penaeidae, Phronimidae, Phyllodocidae, Pontellidae, Porcellanidae, Porpitidae, Pyrocystaceae, Rhincalanidae, Salpidae, Sapphirinidae, Scinidae, Sergestidae, Squillidae, Temoridae, Tomopteridae
Tribe Alciopini
Genus Aetideus, Aglaura, Arietellus, Atlanta, Copilia, Coscinodiscus, Diatoma, Evadne, Haloptilus, Lauderia, Lubbockia, Neoceratium, Noctiluca, Obelia, Orbulina, Penilia, Podon, Pterotrachea
Species Abylopsis tetragona, Bassia bassensis, Branchiostoma lanceolatum, Calocalanus pavo, Cavolinia inflexa, Creseis acicula, Creseis virgula, Cymbulia peronii, Diacavolinia angulata, Diacria trispinosa, Hyalocylis striata, Isias clavipes, Katagnymene spiralis, Mecynocera clausi, Pontellina plumata, Rhopalonema velatum, Solmundella bitentaculata, Styliola subula, Telodiacria quadridentata

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2009-09-07 / 2013-10-27

Дополнительные метаданные

Описание частоты обновления ресурса periodic review of origin data
Альтернативные идентификаторы https://ipt.gbif.org/resource?r=dasid_6512