Plankton community in Bongo net (300µm), Tara Oceans cruise

Evento de amostragem
Versão mais recente publicado em 27 de agosto de 2024

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 202 registros em English (374 KB) - Frequência de atualização: desconhecido
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Descrição

Tara expeditions sampled the world's oceans with standardized protocols, putting an exceptional effort into sampling plankton diversity across a large size range, using a combination of water samples and net tows. The efforts to explore the genomic diversity of plankton, through metabarcoding and metagenomics, have led to well publicized papers and have made the renown of Tara. While a similar extensive effort has been put on imaging, the datasets are not public yet. In a limited number of stations, in addition to the usual 5µm -> ~5cm Tara sampling strategy, Bongo net samples were taken during the day and during the night, at the same station; this is the content of this dataset. Using a 300µm mesh net, it cover organisms from 300µm to ~3cm more Bongo net (300µm mesh) hauled vertically from 500m depth to the surface, once during the day, and once during the night. Sample preserved in 4% buffered formalin and stored over the long term at the Centre de Collections Planctoniques de Villefranche (CCPv). Sample scanned on a ZooScan, images processed with ZooProcess and sorted taxonomically on EcoTaxa, within the Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv). The PIQv and CCPv platforms are part of EMBRC-France, a national Research Infrastructure supported by ANR, under the reference ANR-10-INSB-02.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de evento de amostragem foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 202 registros.

Também existem 2 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

Event (core)
202
ExtendedMeasurementOrFact 
26818
Occurrence 
9656

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso não foi registrado pelo GBIF

Palavras-chave

Plankton; Imaging; EcoTaxa; Samplingevent

Contatos

Amanda Elineau
  • Originador
Céline Dimier
  • Originador
Fabien Lombard
  • Originador
  • Ponto De Contato
Gaby Gorsky
  • Originador
Jean-Baptiste Romagnan
  • Originador
Jean-Olivier Irisson
  • Provedor Dos Metadados
  • Originador
Laetitia Jalabert
  • Originador
Lars Stemmann
  • Originador
Marc Picheral
  • Originador
Natalia Llopis Monferrer
Sarah Searson
  • Originador
Stéphane Pesant
  • Originador
Stefanie Kandels-Lewis
  • Originador
EMBL
DE
European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Heidelberg
Institut de la Mer de Villefranche (IMEV)
MARUM, Center for Marine Environmental Sciences, University of Bremen
Sorbonne Université/CNRS, Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV)
Sorbonne Université/CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV)
Sorbonne Université/CNRS, Station Biologique de Roscoff
Tara Oceans Consortium

Cobertura Geográfica

See coordinates

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-64,355, -168,348], Norte Leste [79,218, 174,86]

Cobertura Taxonômica

Nenhuma descrição disponível

Subreino Harosa
Filo Annelida, Bryozoa, Chaetognatha, Cnidaria, Ctenophora, Cyanobacteria, Echinodermata, Foraminifera, Mollusca, Nemertea
Subfilo Crustacea
Class Acantharia, Actinopterygii, Appendicularia, Bivalvia, Cephalopoda, Echinoidea, Hydrozoa, Insecta, Ophiuroidea, Ostracoda, Scyphozoa, Thaliacea
Subclasse Copepoda, Eumalacostraca, Phaeodaria
Superordem Cladocera
Ordem Actiniaria, Amphipoda, Calanoida, Cumacea, Doliolida, Euphausiacea, Harpacticoida, Isopoda, Monstrilloida, Mysida, Pteropoda, Pyrosomatida, Salpida, Siphonophorae, Spumellaria
Subordem Gymnosomata, Hyperiidea, Physonectae
Infraordem Achelata, Brachyura
Família Abylidae, Acartiidae, Calanidae, Candaciidae, Cavoliniidae, Centropagidae, Cliidae, Corycaeidae, Creseidae, Diphyidae, Eucalanidae, Euchaetidae, Fritillariidae, Galatheidae, Gammaridae, Heterorhabdidae, Hippopodiidae, Laomediidae, Limacinidae, Metridinidae, Oikopleuridae, Oithonidae, Oncaeidae, Oxycephalidae, Penaeidae, Phronimidae, Phyllodocidae, Pontellidae, Porcellanidae, Porpitidae, Pyrocystaceae, Rhincalanidae, Salpidae, Sapphirinidae, Scinidae, Sergestidae, Squillidae, Temoridae, Tomopteridae
Tribo Alciopini
Gênero Aetideus, Aglaura, Arietellus, Atlanta, Copilia, Coscinodiscus, Diatoma, Evadne, Haloptilus, Lauderia, Lubbockia, Neoceratium, Noctiluca, Obelia, Orbulina, Penilia, Podon, Pterotrachea
Espécie Abylopsis tetragona, Bassia bassensis, Branchiostoma lanceolatum, Calocalanus pavo, Cavolinia inflexa, Creseis acicula, Creseis virgula, Cymbulia peronii, Diacavolinia angulata, Diacria trispinosa, Hyalocylis striata, Isias clavipes, Katagnymene spiralis, Mecynocera clausi, Pontellina plumata, Rhopalonema velatum, Solmundella bitentaculata, Styliola subula, Telodiacria quadridentata

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2009-09-07 / 2013-10-27

Metadados Adicionais

Descrição da manutenção periodic review of origin data
Identificadores alternativos https://ipt.gbif.org/resource?r=dasid_6512