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Plankton community in Bongo net (300µm), Tara Oceans cruise

Versão mais recente publicado em Apr 16, 2021
Este recurso não foi registrado pelo GBIF

Tara expeditions sampled the world's oceans with standardized protocols, putting an exceptional effort into sampling plankton diversity across a large size range, using a combination of water samples and net tows. The efforts to explore the genomic diversity of plankton, through metabarcoding and metagenomics, have led to well publicized papers and have made the renown of Tara. While a similar extensive effort has been put on imaging, the datasets are not public yet. In a limited number of stations, in addition to the usual 5µm -> ~5cm Tara sampling strategy, Bongo net samples were taken during the day and during the night, at the same station; this is the content of this dataset. Using a 300µm mesh net, it cover organisms from 300µm to ~3cm more Bongo net (300µm mesh) hauled vertically from 500m depth to the surface, once during the day, and once during the night. Sample preserved in 4% buffered formalin and stored over the long term at the Centre de Collections Planctoniques de Villefranche (CCPv). Sample scanned on a ZooScan, images processed with ZooProcess and sorted taxonomically on EcoTaxa, within the Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv). The PIQv and CCPv platforms are part of EMBRC-France, a national Research Infrastructure supported by ANR, under the reference ANR-10-INSB-02.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de evento de amostragem foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 202 registros. Também existem 2 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

  • Event (core)
    202
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    9982
  • Occurrence 
    9376

Este IPT armazena os dados e, portanto, serve como um repositório de dados. Os dados e os metadados do recurso estão disponíveis para download no seção de downloads. A tabela de versões lista outras versões do recurso que foram disponibilizadas ao público e permite o rastreamento das alterações realizadas no recurso ao longo do tempo.

Downloads

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 202 registros em English (165 KB) - Frequência de atualização: desconhecido
Metadados como um arquivo EML download em English (34 KB)
Metadados como um arquivo RTF download em English (8 KB)

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso não foi registrado pelo GBIF

Palavras-chave

Plankton; Imaging; EcoTaxa; Samplingevent

Contatos

Quem criou esse recurso:

Marc Picheral
Jean-Olivier Irisson
Amanda Elineau
Jean-Baptiste Romagnan
Fabien Lombard
Lars Stemmann
Gaby Gorsky
Laetitia Jalabert
Natalia Llopis Monferrer
Stéphane Pesant
Céline Dimier
Sarah Searson
Stefanie Kandels-Lewis
EMBL DE

Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Fabien Lombard

Quem preencher os metadados:

Jean-Olivier Irisson

Cobertura Geográfica

See coordinates

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-64.355, -168.348], Norte Leste [79.218, 174.86]

Cobertura Taxonômica

Nenhuma descrição disponível

Subreino  Harosa
Filo  Nemertea,  Cyanobacteria,  Mollusca,  Echinodermata,  Ctenophora,  Cnidaria,  Chaetognatha,  Annelida,  Foraminifera,  Bryozoa
Subfilo  Crustacea
Class  Scyphozoa,  Hydrozoa,  Ostracoda,  Cephalopoda,  Bivalvia,  Appendicularia,  Insecta,  Actinopterygii,  Acantharia,  Echinoidea,  Ophiuroidea,  Thaliacea
Subclasse  Phaeodaria,  Eumalacostraca,  Copepoda
Superordem  Cladocera
Ordem  Monstrilloida,  Harpacticoida,  Calanoida,  Pteropoda,  Spumellaria,  Salpida,  Pyrosomatida,  Doliolida,  Actiniaria,  Siphonophorae,  Isopoda,  Cumacea,  Amphipoda,  Euphausiacea,  Mysida
Subordem  Gymnosomata,  Hyperiidea,  Physonectae
Infraordem  Achelata,  Brachyura
Família  Temoridae,  Rhincalanidae,  Pontellidae,  Metridinidae,  Tomopteridae,  Heterorhabdidae,  Euchaetidae,  Eucalanidae,  Phyllodocidae,  Centropagidae,  Candaciidae,  Calanidae,  Acartiidae,  Oithonidae,  Diphyidae,  Sapphirinidae,  Oncaeidae,  Corycaeidae,  Pyrocystaceae,  Abylidae,  Oxycephalidae,  Scinidae,  Phronimidae,  Fritillariidae,  Oikopleuridae,  Gammaridae,  Cliidae,  Cavoliniidae,  Limacinidae,  Creseidae,  Galatheidae,  Hippopodiidae,  Laomediidae,  Penaeidae,  Porcellanidae,  Porpitidae,  Salpidae,  Sergestidae,  Squillidae
Tribo  Alciopini
Gênero  Penilia,  Podon,  Evadne,  Diatoma,  Noctiluca,  Copilia,  Lauderia,  Coscinodiscus,  Obelia,  Orbulina,  Aglaura,  Aetideus,  Haloptilus,  Neoceratium,  Lubbockia,  Arietellus,  Pterotrachea,  Atlanta
Espécie  Hyalocylis striata,  Abylopsis tetragona,  Calocalanus pavo,  Mecynocera clausi,  Pontellina plumata,  Diacavolinia angulata,  Bassia bassensis,  Styliola subula,  Katagnymene spiralis,  Isias clavipes,  Cavolinia inflexa,  Creseis virgula,  Creseis acicula,  Solmundella bitentaculata,  Rhopalonema velatum,  Diacria trispinosa,  Telodiacria quadridentata,  Cymbulia peronii,  Branchiostoma lanceolatum,  Agalma elegans

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2009-09-07 / 2013-10-27

Metadados Adicionais

Descrição da manutenção periodic review of origin data
Identificadores alternativos https://ipt.gbif.org/resource?r=dasid_6512