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Plankton community in Bongo net (300µm), Tara Oceans cruise

最新バージョン 公開されました。 Apr 16, 2021
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Tara expeditions sampled the world's oceans with standardized protocols, putting an exceptional effort into sampling plankton diversity across a large size range, using a combination of water samples and net tows. The efforts to explore the genomic diversity of plankton, through metabarcoding and metagenomics, have led to well publicized papers and have made the renown of Tara. While a similar extensive effort has been put on imaging, the datasets are not public yet. In a limited number of stations, in addition to the usual 5µm -> ~5cm Tara sampling strategy, Bongo net samples were taken during the day and during the night, at the same station; this is the content of this dataset. Using a 300µm mesh net, it cover organisms from 300µm to ~3cm more Bongo net (300µm mesh) hauled vertically from 500m depth to the surface, once during the day, and once during the night. Sample preserved in 4% buffered formalin and stored over the long term at the Centre de Collections Planctoniques de Villefranche (CCPv). Sample scanned on a ZooScan, images processed with ZooProcess and sorted taxonomically on EcoTaxa, within the Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv). The PIQv and CCPv platforms are part of EMBRC-France, a national Research Infrastructure supported by ANR, under the reference ANR-10-INSB-02.

データ レコード

この sampling event リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、202 レコードが含まれています。 拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

  • Event (コア)
    202
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    9982
  • Occurrence 
    9376

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

ダウンロード

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 202 レコード English で (165 KB) - 更新頻度: unknown
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (34 KB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (8 KB)

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF登録

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キーワード

Plankton; Imaging; EcoTaxa; Samplingevent

連絡先

リソースを作成した人:

Marc Picheral
Jean-Olivier Irisson
Amanda Elineau
Jean-Baptiste Romagnan
Fabien Lombard
Lars Stemmann
Gaby Gorsky
Laetitia Jalabert
Natalia Llopis Monferrer
Stéphane Pesant
Céline Dimier
Sarah Searson
Stefanie Kandels-Lewis
EMBL DE

リソースに関する質問に答えることができる人:

Fabien Lombard

メタデータを記載した人:

Jean-Olivier Irisson

地理的範囲

See coordinates

座標(緯度経度) 南 西 [-64.355, -168.348], 北 東 [79.218, 174.86]

生物分類学的範囲

説明がありません

Subkingdom  Harosa
Phylum  Nemertea,  Cyanobacteria,  Mollusca,  Echinodermata,  Ctenophora,  Cnidaria,  Chaetognatha,  Annelida,  Foraminifera,  Bryozoa
Subphylum  Crustacea
Class  Scyphozoa,  Hydrozoa,  Ostracoda,  Cephalopoda,  Bivalvia,  Appendicularia,  Insecta,  Actinopterygii,  Acantharia,  Echinoidea,  Ophiuroidea,  Thaliacea
Subclass  Phaeodaria,  Eumalacostraca,  Copepoda
Superorder  Cladocera
Order  Monstrilloida,  Harpacticoida,  Calanoida,  Pteropoda,  Spumellaria,  Salpida,  Pyrosomatida,  Doliolida,  Actiniaria,  Siphonophorae,  Isopoda,  Cumacea,  Amphipoda,  Euphausiacea,  Mysida
Suborder  Gymnosomata,  Hyperiidea,  Physonectae
Infraorder  Achelata,  Brachyura
Family  Temoridae,  Rhincalanidae,  Pontellidae,  Metridinidae,  Tomopteridae,  Heterorhabdidae,  Euchaetidae,  Eucalanidae,  Phyllodocidae,  Centropagidae,  Candaciidae,  Calanidae,  Acartiidae,  Oithonidae,  Diphyidae,  Sapphirinidae,  Oncaeidae,  Corycaeidae,  Pyrocystaceae,  Abylidae,  Oxycephalidae,  Scinidae,  Phronimidae,  Fritillariidae,  Oikopleuridae,  Gammaridae,  Cliidae,  Cavoliniidae,  Limacinidae,  Creseidae,  Galatheidae,  Hippopodiidae,  Laomediidae,  Penaeidae,  Porcellanidae,  Porpitidae,  Salpidae,  Sergestidae,  Squillidae
Tribe  Alciopini
Genus  Penilia,  Podon,  Evadne,  Diatoma,  Noctiluca,  Copilia,  Lauderia,  Coscinodiscus,  Obelia,  Orbulina,  Aglaura,  Aetideus,  Haloptilus,  Neoceratium,  Lubbockia,  Arietellus,  Pterotrachea,  Atlanta
Species  Hyalocylis striata,  Abylopsis tetragona,  Calocalanus pavo,  Mecynocera clausi,  Pontellina plumata,  Diacavolinia angulata,  Bassia bassensis,  Styliola subula,  Katagnymene spiralis,  Isias clavipes,  Cavolinia inflexa,  Creseis virgula,  Creseis acicula,  Solmundella bitentaculata,  Rhopalonema velatum,  Diacria trispinosa,  Telodiacria quadridentata,  Cymbulia peronii,  Branchiostoma lanceolatum,  Agalma elegans

時間的範囲

開始日 / 終了日 2009-09-07 / 2013-10-27

追加のメタデータ

メンテナンス内容 periodic review of origin data
代替識別子 https://ipt.gbif.org/resource?r=dasid_6512