Description
Tara expeditions sampled the world's oceans with standardized protocols, putting an exceptional effort into sampling plankton diversity across a large size range, using a combination of water samples and net tows. The efforts to explore the genomic diversity of plankton, through metabarcoding and metagenomics, have led to well publicized papers and have made the renown of Tara. While a similar extensive effort has been put on imaging, the datasets are not public yet. In a limited number of stations, in addition to the usual 5µm -> ~5cm Tara sampling strategy, Bongo net samples were taken during the day and during the night, at the same station; this is the content of this dataset. Using a 300µm mesh net, it cover organisms from 300µm to ~3cm more Bongo net (300µm mesh) hauled vertically from 500m depth to the surface, once during the day, and once during the night. Sample preserved in 4% buffered formalin and stored over the long term at the Centre de Collections Planctoniques de Villefranche (CCPv). Sample scanned on a ZooScan, images processed with ZooProcess and sorted taxonomically on EcoTaxa, within the Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv). The PIQv and CCPv platforms are part of EMBRC-France, a national Research Infrastructure supported by ANR, under the reference ANR-10-INSB-02.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 202 enregistrements.
2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource n'a pas été enregistrée sur le portail GBIF
Mots-clé
Plankton; Imaging; EcoTaxa; Samplingevent
Contacts
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Couverture géographique
See coordinates
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [-64,355, -168,348], Nord Est [79,218, 174,86] |
|---|
Couverture taxonomique
Pas de description disponible
| Subkingdom | Harosa |
|---|---|
| Phylum | Annelida, Bryozoa, Chaetognatha, Cnidaria, Ctenophora, Cyanobacteria, Echinodermata, Foraminifera, Mollusca, Nemertea |
| Subphylum | Crustacea |
| Class | Acantharia, Actinopterygii, Appendicularia, Bivalvia, Cephalopoda, Echinoidea, Hydrozoa, Insecta, Ophiuroidea, Ostracoda, Scyphozoa, Thaliacea |
| Subclass | Copepoda, Eumalacostraca, Phaeodaria |
| Superorder | Cladocera |
| Order | Actiniaria, Amphipoda, Calanoida, Cumacea, Doliolida, Euphausiacea, Harpacticoida, Isopoda, Monstrilloida, Mysida, Pteropoda, Pyrosomatida, Salpida, Siphonophorae, Spumellaria |
| Suborder | Gymnosomata, Hyperiidea, Physonectae |
| Infraorder | Achelata, Brachyura |
| Family | Abylidae, Acartiidae, Calanidae, Candaciidae, Cavoliniidae, Centropagidae, Cliidae, Corycaeidae, Creseidae, Diphyidae, Eucalanidae, Euchaetidae, Fritillariidae, Galatheidae, Gammaridae, Heterorhabdidae, Hippopodiidae, Laomediidae, Limacinidae, Metridinidae, Oikopleuridae, Oithonidae, Oncaeidae, Oxycephalidae, Penaeidae, Phronimidae, Phyllodocidae, Pontellidae, Porcellanidae, Porpitidae, Pyrocystaceae, Rhincalanidae, Salpidae, Sapphirinidae, Scinidae, Sergestidae, Squillidae, Temoridae, Tomopteridae |
| Tribe | Alciopini |
| Genus | Aetideus, Aglaura, Arietellus, Atlanta, Copilia, Coscinodiscus, Diatoma, Evadne, Haloptilus, Lauderia, Lubbockia, Neoceratium, Noctiluca, Obelia, Orbulina, Penilia, Podon, Pterotrachea |
| Species | Abylopsis tetragona, Bassia bassensis, Branchiostoma lanceolatum, Calocalanus pavo, Cavolinia inflexa, Creseis acicula, Creseis virgula, Cymbulia peronii, Diacavolinia angulata, Diacria trispinosa, Hyalocylis striata, Isias clavipes, Katagnymene spiralis, Mecynocera clausi, Pontellina plumata, Rhopalonema velatum, Solmundella bitentaculata, Styliola subula, Telodiacria quadridentata |
Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2009-09-07 / 2013-10-27 |
|---|
Métadonnées additionnelles
| Description de la fréquence de mise à jour | periodic review of origin data |
|---|---|
| Identifiants alternatifs | https://ipt.gbif.org/resource?r=dasid_6512 |