Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus

Событие
Последняя версия опубликовано Training Organization мая 4, 2026 Training Organization
Дата публикации:
4 мая 2026 г.
Опубликовано:
Training Organization
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 62 Записи в English (7 KB) - Частота обновления: по мере необходимости
Метаданные в формате EML Скачать в English (8 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (8 KB)

Описание

This dataset contains occurrence records of bacterial isolates obtained from rectal samples of wild rodents (Apodemus flavicollis or yellow-necked mouse and Myodes glareolus or bank vole) collected in Bulgaria. Animals were trapped and sampled in the field; rectal material was suspended in nutrient medium and subsequently processed in the Department of Infectious Microbiology of the Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences (SAIM-BAS), where bacterial isolates were cultured, purified, and identified using biochemical methods or PCR. The isolates identified via BD PhoenixTM gave a confidence value of 99%, unless otherwise specified in parenthesisEach record represents a bacterial isolate derived from a specific host individual at a defined place and time. Isolates are maintained as live cryopreserved pure cultures in the SAIM-BAS collection.Isolate identifiers follow the format SAIM-BAS-YI-[Roman numeral]-[Arabic numeral], where the Roman numeral denotes the host individual and the Arabic numeral denotes the isolate number corresponding to a table in the associated publication. These identifiers are provided in the organismID field and uniquely link GBIF records to the physical strains in the collection. The field eventID represents individual host animals. All bacterial isolates derived from the same host share the same eventID, allowing linkage of multiple isolates to a single sampled individual.The presence of bacteria is confirmed from cultured material and reflects host-associated occurrence; records do not represent environmental prevalence. Host animals showed no clinical signs at the time of sampling; isolates are therefore considered likely commensal. Multiple isolates of the same species per host may be present.In addition, the host rodents were tested for African swine fever virus, but it was not detected using PCR.

Записи данных

Данные этого находка ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 62 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Ilieva Y (2026). Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus. Version 1.0. Training Organization. Occurrence dataset. https://ipt.gbif.org/resource?r=bacteria_in_bulgarian_wild_mice_and_voles&v=1.0

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Training Organization. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: b9abfa2f-cb27-4a80-b85e-e61d815ce21c.  Training Organization отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Secretariat.

Ключевые слова

Occurrence

Контакты

Yana Ilieva
  • Point Of Contact
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Yana Ilieva
  • Point Of Contact
  • Chief Assistant professor
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Michaela Beltcheva
  • Author
Institute of Biodiversity and Ecosystem Research, Bulgarian Academy of Sciences

Географический охват

Skakavtsite, Rila mountain, 1500 m above sea level, Bulgaria

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Kingdom Bacteria, Viruses
Phylum Nucleocytoviricota, Bacillota, Pseudomonadota

Библиографические ссылки

  1. Ilieva, Y., Zaharieva, M.M., Dimitrova, L., Kaleva, M.D., Jordanova, J., Dimitrova, M., Beltcheva, M., Aleksieva, I., Georgiev, Y., Manasiev, Y., Najdenski, H. Preliminary Data on Escherichia coli, Yersinia enterocolitica, and Other Bacteria, as Well as Absent African Swine Fever Virus in the Gut Microbiota of Wild Mice and Voles from Bulgaria. Microbiol. Res. 2023, 14, 1788–1819. https://doi.org/10.3390/microbiolres14040123 DOI

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы https://ipt.gbif.org/resource?r=bacteria_in_bulgarian_wild_mice_and_voles