Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus

Occurrence
最新バージョン Training Organization により出版 5月 4, 2026 Training Organization
公開日:
2026年5月4日
ライセンス:
CC-BY 4.0

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説明

This dataset contains occurrence records of bacterial isolates obtained from rectal samples of wild rodents (Apodemus flavicollis or yellow-necked mouse and Myodes glareolus or bank vole) collected in Bulgaria. Animals were trapped and sampled in the field; rectal material was suspended in nutrient medium and subsequently processed in the Department of Infectious Microbiology of the Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences (SAIM-BAS), where bacterial isolates were cultured, purified, and identified using biochemical methods or PCR. The isolates identified via BD PhoenixTM gave a confidence value of 99%, unless otherwise specified in parenthesisEach record represents a bacterial isolate derived from a specific host individual at a defined place and time. Isolates are maintained as live cryopreserved pure cultures in the SAIM-BAS collection.Isolate identifiers follow the format SAIM-BAS-YI-[Roman numeral]-[Arabic numeral], where the Roman numeral denotes the host individual and the Arabic numeral denotes the isolate number corresponding to a table in the associated publication. These identifiers are provided in the organismID field and uniquely link GBIF records to the physical strains in the collection. The field eventID represents individual host animals. All bacterial isolates derived from the same host share the same eventID, allowing linkage of multiple isolates to a single sampled individual.The presence of bacteria is confirmed from cultured material and reflects host-associated occurrence; records do not represent environmental prevalence. Host animals showed no clinical signs at the time of sampling; isolates are therefore considered likely commensal. Multiple isolates of the same species per host may be present.In addition, the host rodents were tested for African swine fever virus, but it was not detected using PCR.

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、62 レコードが含まれています。

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バージョン

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引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Ilieva Y (2026). Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus. Version 1.0. Training Organization. Occurrence dataset. https://ipt.gbif.org/resource?r=bacteria_in_bulgarian_wild_mice_and_voles&v=1.0

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Training Organization。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: b9abfa2f-cb27-4a80-b85e-e61d815ce21cが割り当てられています。   GBIF Secretariat によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているTraining Organization が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence

連絡先

Yana Ilieva
  • 連絡先
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Yana Ilieva
  • 連絡先
  • Chief Assistant professor
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Michaela Beltcheva
  • 論文著者
Institute of Biodiversity and Ecosystem Research, Bulgarian Academy of Sciences

地理的範囲

Skakavtsite, Rila mountain, 1500 m above sea level, Bulgaria

座標（緯度経度） 南 西 [-90, -180], 北 東 [90, 180]

生物分類学的範囲

説明がありません

Kingdom Bacteria, Viruses
Phylum Nucleocytoviricota, Bacillota, Pseudomonadota

書誌情報の引用

  1. Ilieva, Y., Zaharieva, M.M., Dimitrova, L., Kaleva, M.D., Jordanova, J., Dimitrova, M., Beltcheva, M., Aleksieva, I., Georgiev, Y., Manasiev, Y., Najdenski, H. Preliminary Data on Escherichia coli, Yersinia enterocolitica, and Other Bacteria, as Well as Absent African Swine Fever Virus in the Gut Microbiota of Wild Mice and Voles from Bulgaria. Microbiol. Res. 2023, 14, 1788–1819. https://doi.org/10.3390/microbiolres14040123 DOI