Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus

Occurrence
Dernière version Publié par Training Organization le mai 4, 2026 Training Organization
Date de publication:
4 mai 2026
Publié par:
Training Organization
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

This dataset contains occurrence records of bacterial isolates obtained from rectal samples of wild rodents (Apodemus flavicollis or yellow-necked mouse and Myodes glareolus or bank vole) collected in Bulgaria. Animals were trapped and sampled in the field; rectal material was suspended in nutrient medium and subsequently processed in the Department of Infectious Microbiology of the Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences (SAIM-BAS), where bacterial isolates were cultured, purified, and identified using biochemical methods or PCR. The isolates identified via BD PhoenixTM gave a confidence value of 99%, unless otherwise specified in parenthesisEach record represents a bacterial isolate derived from a specific host individual at a defined place and time. Isolates are maintained as live cryopreserved pure cultures in the SAIM-BAS collection.Isolate identifiers follow the format SAIM-BAS-YI-[Roman numeral]-[Arabic numeral], where the Roman numeral denotes the host individual and the Arabic numeral denotes the isolate number corresponding to a table in the associated publication. These identifiers are provided in the organismID field and uniquely link GBIF records to the physical strains in the collection. The field eventID represents individual host animals. All bacterial isolates derived from the same host share the same eventID, allowing linkage of multiple isolates to a single sampled individual.The presence of bacteria is confirmed from cultured material and reflects host-associated occurrence; records do not represent environmental prevalence. Host animals showed no clinical signs at the time of sampling; isolates are therefore considered likely commensal. Multiple isolates of the same species per host may be present.In addition, the host rodents were tested for African swine fever virus, but it was not detected using PCR.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 62 enregistrements.

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Ilieva Y (2026). Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus. Version 1.0. Training Organization. Occurrence dataset. https://ipt.gbif.org/resource?r=bacteria_in_bulgarian_wild_mice_and_voles&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Training Organization. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : b9abfa2f-cb27-4a80-b85e-e61d815ce21c.  Training Organization publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du GBIF Secretariat.

Mots-clé

Occurrence

Contacts

Yana Ilieva
  • Personne De Contact
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Yana Ilieva
  • Personne De Contact
  • Chief Assistant professor
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Michaela Beltcheva
  • Auteur
Institute of Biodiversity and Ecosystem Research, Bulgarian Academy of Sciences

Couverture géographique

Skakavtsite, Rila mountain, 1500 m above sea level, Bulgaria

Enveloppe géographique Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Kingdom Bacteria, Viruses
Phylum Nucleocytoviricota, Bacillota, Pseudomonadota

Citations bibliographiques

  1. Ilieva, Y., Zaharieva, M.M., Dimitrova, L., Kaleva, M.D., Jordanova, J., Dimitrova, M., Beltcheva, M., Aleksieva, I., Georgiev, Y., Manasiev, Y., Najdenski, H. Preliminary Data on Escherichia coli, Yersinia enterocolitica, and Other Bacteria, as Well as Absent African Swine Fever Virus in the Gut Microbiota of Wild Mice and Voles from Bulgaria. Microbiol. Res. 2023, 14, 1788–1819. https://doi.org/10.3390/microbiolres14040123 DOI

Métadonnées additionnelles