Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus

Registro biológico
Última versión publicado por Training Organization el may 4, 2026 Training Organization
Fecha de publicación:
4 de mayo de 2026
Publicado por:
Training Organization
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

This dataset contains occurrence records of bacterial isolates obtained from rectal samples of wild rodents (Apodemus flavicollis or yellow-necked mouse and Myodes glareolus or bank vole) collected in Bulgaria. Animals were trapped and sampled in the field; rectal material was suspended in nutrient medium and subsequently processed in the Department of Infectious Microbiology of the Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences (SAIM-BAS), where bacterial isolates were cultured, purified, and identified using biochemical methods or PCR. The isolates identified via BD PhoenixTM gave a confidence value of 99%, unless otherwise specified in parenthesisEach record represents a bacterial isolate derived from a specific host individual at a defined place and time. Isolates are maintained as live cryopreserved pure cultures in the SAIM-BAS collection.Isolate identifiers follow the format SAIM-BAS-YI-[Roman numeral]-[Arabic numeral], where the Roman numeral denotes the host individual and the Arabic numeral denotes the isolate number corresponding to a table in the associated publication. These identifiers are provided in the organismID field and uniquely link GBIF records to the physical strains in the collection. The field eventID represents individual host animals. All bacterial isolates derived from the same host share the same eventID, allowing linkage of multiple isolates to a single sampled individual.The presence of bacteria is confirmed from cultured material and reflects host-associated occurrence; records do not represent environmental prevalence. Host animals showed no clinical signs at the time of sampling; isolates are therefore considered likely commensal. Multiple isolates of the same species per host may be present.In addition, the host rodents were tested for African swine fever virus, but it was not detected using PCR.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 62 registros.

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Versiones

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¿Cómo referenciar?

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Ilieva Y (2026). Bacteria in Bulgarian wild mice and voles, as well as absent African swine fever virus. Version 1.0. Training Organization. Occurrence dataset. https://ipt.gbif.org/resource?r=bacteria_in_bulgarian_wild_mice_and_voles&v=1.0

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Training Organization. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: b9abfa2f-cb27-4a80-b85e-e61d815ce21c.  Training Organization publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Secretariat.

Palabras clave

Occurrence

Contactos

Yana Ilieva
  • Punto De Contacto
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Yana Ilieva
  • Punto De Contacto
  • Chief Assistant professor
The Stephan Angeloff Institute of Microbiology, Bulgarian Academy of Sciences
Sofia
Bulgaria
Michaela Beltcheva
  • Autor
Institute of Biodiversity and Ecosystem Research, Bulgarian Academy of Sciences

Cobertura geográfica

Skakavtsite, Rila mountain, 1500 m above sea level, Bulgaria

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180]

Cobertura taxonómica

No hay descripción disponible

Reino Bacteria, Viruses
Filo Nucleocytoviricota, Bacillota, Pseudomonadota

Referencias bibliográficas

  1. Ilieva, Y., Zaharieva, M.M., Dimitrova, L., Kaleva, M.D., Jordanova, J., Dimitrova, M., Beltcheva, M., Aleksieva, I., Georgiev, Y., Manasiev, Y., Najdenski, H. Preliminary Data on Escherichia coli, Yersinia enterocolitica, and Other Bacteria, as Well as Absent African Swine Fever Virus in the Gut Microbiota of Wild Mice and Voles from Bulgaria. Microbiol. Res. 2023, 14, 1788–1819. https://doi.org/10.3390/microbiolres14040123 DOI

Metadatos adicionales